Preparazione di librerie per il sequenziamento di nuova generazione (NGS)
La creazione di librerie per il sequenziamento di nuova generazione (Next-Generation Sequencing, NGS) è un processo laborioso e impegnativo che può richiedere da 2 ore e mezza fino a diversi giorni per essere completato, a seconda del tipo di libreria creata. È necessario prestare molta attenzione e registrare con precisione l’adattatore ricevuto da ogni singolo campione. Il pipettaggio manuale di campioni e i reagenti può causare incongruenze, rischiando di invalidare campioni preziosi. L'automazione della preparazione delle librerie NGS può ridurre al minimo i rischi e i problemi derivanti dall'elaborazione manuale. Beckman Coulter Life Sciences consente di risolvere i problemi critici delle applicazioni di laboratorio offrendo soluzioni di automazione valide per processi a basso numero di campioni, o ad alta produttività per aumentare il rendimento.
Le workstation Biomek possono essere configurate in base alle esigenze del flusso di lavoro, dai trasferimenti da microlitri a millilitri per l'isolamento degli acidi nucleici da provette di campioni primari, fino alla preparazione di librerie pronte per il sequenziamento. I manipolatori di liquidi acustici Echo consentono di effettuare trasferimenti da nanolitri a microlitri e di contenere così i costi di preparazione delle librerie attraverso la miniaturizzazione del volume di reazione e i trasferimenti acustici senza contatto.
Un esempio di flusso di lavoro di sequenziamento NGS
Workstation Biomek per NGS
Consentendo di ottenere una maggiore produttività, aumentando l'efficienza e riducendo i tempi necessari per le operazioni manuali, le workstation Biomek offrono la flessibilità necessaria per ottimizzare la programmazione della giornata di lavoro. I metodi supportati dai dati di Biomek vengono sviluppati in collaborazione con i principali fornitori tecnologici utilizzando campioni reali. Questi metodi possono essere applicati in modalità completamente automatizzata in tutte le fasi e prevedono punti di inizio e fine opzionali in base alle raccomandazioni del fornitore del kit.
Le workstation Biomek offrono soluzioni di automazione scalabili per tutte le fasi previste nei flussi di lavoro di preparazione dei campioni NGS, dall'estrazione alla creazione della libreria. Le configurazioni Biomek sono flessibili e includono la funzionalità di incubazione on-deck, la separazione con biglie magnetiche e l'agitazione, oltre a contenitori opzionali e al termociclaggio on-deck, in base alle esigenze dell'utente.
Workstation Biomek con manipolatore di liquidi Echo
L'uso della workstation Biomek con un manipolatore di liquidi Echo consente di automatizzare completamente il flusso di lavoro sfruttando tutti i vantaggi della dispensazione acustica. Il manipolatore di liquidi Echo può essere integrato direttamente nella workstation Biomek, che effettuerà il controllo dei protocolli Echo, consentendo agli strumenti di interagire per portare a termine un flusso di lavoro complesso. La workstation Biomek include inoltre le funzionalità di miscelazione, agitazione e termociclaggio, offrendo così una soluzione completamente automatizzata.
- L’integrazione con il manipolatore di liquidi Echo consente ai metodi Biomek di analizzare le piastre utilizzando i protocolli Echo
- I protocolli sviluppati utilizzando il manipolatore di liquidi Echo come strumento indipendente possono essere automatizzati tramite i metodi Biomek
- Esegui uno o più protocolli Echo con i metodi Biomek
- Esegui un protocollo Echo completo in un'unica operazione, oppure analizza solo le piastre selezionate nel protocollo Echo
- Utilizza tutte le funzionalità dell'applicazione Echo, compresi i rapporti applicativi e il contenuto identico dei pozzetti
- Assegna visivamente le piastre ai protocolli Echo o utilizza piastre con codice a barre e un file di trasferimento della lista di prelievo Echo
- I dati relativi al volume dei pozzetti, all’erogazione e alle eccezioni del manipolatore di liquidi Echo vengono assegnati alle piastre gestite con il metodo Biomek per effettuare ulteriori calcoli e preparare rapporti
Workstation Biomek 4000
La workstation Biomek 4000 permette di automatizzare i flussi di lavoro NGS per ridurre al minimo i tempi necessari per le operazioni manuali ed è indicata per i laboratori che ancora non utilizzano soluzioni di automazione.
- Scalabilità estesa grazie a 12 posizioni on-deck e 4 supporti off-deck
- Massima flessibilità con testine di pipettaggio a 1 o 8 canali e possibilità di interscambio rapido e automatico tra gli strumenti
Workstation Biomek i7
La workstation Biomek i7 rappresenta una soluzione completamente automatizzata per ottimizzare il ritorno sull'investimento (ROI) ed è indicata per i laboratori ad alta produttività
- Piattaforma spaziosa e aperta con 45 posizioni on-deck per applicazioni ad alta produttività
- Diverse opzioni di configurazione per soddisfare le esigenze di ogni flusso di lavoro; ad esempio, stazione di lavoro ibrida con pod multicanale, pod Span-8 e due gripper indipendenti. Sono disponibili anche altre configurazioni di pipettaggio.
Workstation Biomek i5
La workstation Biomek i5 rappresenta una soluzione di automazione scalabile in base alle esigenze del flusso di lavoro, ed è indicata per i laboratori a media e alta produttività.
- 25 posizioni on-deck per supportare flussi di lavoro di medio livello
- Multicanale o Span-8 con diverse opzioni di gripper per soddisfare le esigenze specifiche di ogni flusso di lavoro
Manipolatori di liquidi Echo per NGS
La tecnologia di manipolazione acustica dei liquidi Echo rivoluziona le applicazioni genomiche utilizzando l'energia del suono per realizzare trasferimenti dei fluidi incredibilmente accurati, completamente automatizzati, senza contatto e senza punta in volumi da nanolitri a microlitri. Utilizzando il trasduttore e la funzionalità proprietaria di analisi dinamica dei fluidi, è possibile trasferire rapidamente più gocce al secondo. I trasferimenti possono essere effettuati da qualsiasi pozzetto di origine a qualsiasi pozzetto di destinazione, in meno di un secondo.
- Trasferimenti accurati e precisi in volumi da nanolitri a microlitri (fino all'8% di CV e fino al 10% di margine di errore) fino a un minimo di 25 nl
- Riduzione dei volumi di reazione dei reagenti più preziosi grazie all'erogazione di nanolitri, con costi fino a 20 volte inferiori per la fase di tagmentazione del flusso di lavoro Nextera XT 1
- Riduzione della possibilità di contaminazione crociata grazie all'erogazione senza contatto
- Riduzione dei tempi necessari per la codifica del codice a barre/indicizzazione, la normalizzazione e il pooling grazie ai trasferimenti senza contatto e senza punta, permettendo di semplificare il flusso di lavoro, con la possibilità, ad esempio, di ridurre del 60% il tempo di assemblaggio della reazione per la dispensazione di oligo-concentrati (45 minuti invece di 2 ore con stock pre-pooled) 2
1 Illumina Nextera XT miniaturizzato su workstation Biomek i5 multicanale 384 e manipolatori di liquidi Echo 525 Nextera 21.08.2252 AUTO
2 Sequenziamento del DNA di prossima generazione e ad alta produttività del SARS-CoV-2 con il manipolatore di liquidi acustico Echo 525, caso di studio di Fry Labs, 21.02.842.AUTO
L'illustrazione del metodo o dell'applicazione è solo a scopo dimostrativo e non è approvata da Beckman Coulter. Beckman Coulter non offre garanzie di alcun tipo, esplicite o implicite, in merito a questo protocollo, incluse, a titolo esemplificativo ma non limitativo, garanzie di idoneità per uno scopo particolare, garanzie di commerciabilità o garanzie di conformità del protocollo. Tutte le garanzie sono espressamente escluse. Beckman Coulter non si assume alcuna responsabilità per l'applicazione del metodo, che avviene esclusivamente a rischio del cliente. Le workstation automatizzate Biomek ed Echo non sono indicate o approvate per la diagnosi delle malattie o di altre condizioni.
I prodotti identificati non devono essere utilizzati in procedure diagnostiche.
© 2021 Beckman Coulter, Inc. Tutti i diritti riservati. Beckman Coulter, il logo stilizzato e i marchi di prodotti e servizi Beckman Coulter sono marchi o marchi registrati di Beckman Coulter, Inc. negli Stati Uniti e in altri Paesi. ECHO è un marchio o marchio registrato di Labcyte Inc. negli Stati Uniti e in altri Paesi. Labcyte è una società di Beckman Coulter.
Tutti gli altri nomi e marchi di prodotti sono di proprietà dei loro rispettivi proprietari.
Talk To An Expert
Workstation Biomek per genomica
