AMPure XP per la purificazione della PCR
Selezione delle dimensioni e pulizia
Si può usare il nostro prodotto chimico basato su biglie paramagnetiche SPRI brevettate per rimuovere i contaminanti (dNTP, sali, primer, dimeri di primer) nei propri flussi di lavoro di sequenziamento di nuova generazione (Next-Generation Sequencing, NGS).
- Utilizzato in una serie di prodotti chimici per la preparazione di librerie NGS
- Compatibile con l’elaborazione manuale e automatizzata
- Elevato recupero di ampliconi >100 bp
- Selezione delle dimensioni prevedibile e uniforme
È necessario un certificato di analisi (Certificate Of Analysis, COA)? Utilizzare la barra di ricerca nella parte superiore della pagina e cercare il numero di lotto.
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Flusso di lavoro di AMPure XP
Caratteristiche del prodotto
AMPure XP rimuove i contaminanti indesiderati dal DNA in una varietà di applicazioni, tra cui PCR, NGS, clonazione e microarray.
Il recupero efficiente del campione garantisce che i dati critici non vadano persi nel flusso di lavoro.
Reagente affidabile e raccomandato per la selezione delle dimensioni e la pulizia in vari flussi di lavoro NGS.
La pulizia manuale con AMPure XP richiede meno di 30 minuti. Per esigenze di capacità produttiva superiori, AMPure XP è automatizzato su tutte le piattaforme Biomek per centinaia di campioni al giorno.
Citazioni
Peffers, M. J., Liu, X., & Clegg, P. D. (8 marzo 2014). Transcriptomic profiling of cartilage ageing. Genomics Data, 2, 27-28. doi:10.1016/j.gdata.2014.03.0011
- Utilizzato per la pulizia del cDNA
Greenwald, W. W., Li, H., Benaglio, P., Jakubosky, D., Matsui, H., Schmitt, A., . . . Frazer, K. A. (5 marzo 2019). Subtle changes in chromatin loop contact propensity are associated with differential gene regulation and expression. Nature Communications, 10(1054), 1-17. doi:https://doi.org/10.1038/s41467-019-08940-51
- Utilizzato per la pulizia delle reazioni PCR con codice a barre durante la preparazione della libreria
Non perdere dati critici
Quando hai investito così tanto nella ricerca, AMPure XP è l’unica scelta per le fasi di purificazione e pulizia. La perdita di rendimento durante questa fase cruciale porta a mancate scoperte nella ricerca.
Costi relativi dei vari passaggi necessari per eseguire più applicazioni NGS. Tali passaggi includono estrazione, costruzione delle librerie, ampliamento delle librerie, pulizia e sequenziamento. I costi sono stati calcolati in base al listino prezzi medio di kit e reagenti disponibili in commercio nel 2017. L’efficienza della pulizia è stata calcolata determinando il rendimento totale del DNA dell’analisi Picogreen dopo l’esecuzione di una procedura di pulizia su una quantità nota di DNA. La percentuale di rendimento in relazione alle prestazioni di AMPure XP è stata quindi utilizzata per calcolare l’impatto dell’efficienza su vari metodi di costruzione delle librerie disponibili in commercio e di un cambiamento nel reagente di purificazione.
AMPure XP è lo standard di riferimento per la pulizia a base di biglie nel sequenziamento di nuova generazione (NGS)
Più di 200 kit di preparazione di librerie raccomandano l’uso di AMPure XP, tra cui i kit di aziende affidabili che si occupano di sequenziamento:
- Illumina®
- Nanopore
- PacBio
- Thermo Scientific
AMPure XP è stato utilizzato in oltre 15.000 pubblicazioni, citate in articoli su Science, Nature e PNAS.
La pulizia e la purificazione dell’acido nucleico sono obbligatorie per le applicazioni genomiche, tra cui sequenziamento, qPCR/ddPCR/PCR e microarray. Massimizzando il recupero, l’uniformità e la velocità, AMPure XP soddisfa le severe esigenze delle applicazioni genomiche contemporanee e minimizza il rischio di perdere importanti informazioni genetiche.
- Elevato recupero di ampliconi, maggiore di 100 bp
- Rimozione efficiente di dNTP non incorporati, primer, dimeri di primer, sali e altri contaminanti
- Selezione delle dimensioni prevedibile e uniforme
“I nostri risultati suggeriscono che AMPure XP potrebbe essere la scelta migliore per analisi che richiedono un rigore analitico molto elevato”. Mikheikin, A., Olsen, A., Picco, L. et al. High-speed atomic force microscopy revealing contamination in DNA purification systems. Anal. Chem. 88:5, 2527-2523 (2016) doi: 10.1021/acs.analchem.5b04023.1
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